导致新生胎儿在获得先天性畸形的原因有6点：
第1点是遗传因素，
第2点是射线因素，
第3点是病毒感染因素，
第4点是孕妇自带的基础疾病，
第5点是缺氧，
第6点是饮酒和化学物质因素。 遗传因素：
遗传因素是新生胎儿的父亲，或者是母亲体内的染色体已经存在异常，而且两人虽没有任何的表现，但体内的基因已经发生病变，生育之后会导致新生胎儿存在先天畸形。
射线因素：
孕妇怀孕期间尽量避免各种射线，例如手机射线电脑辐射以及地球上的放射性物质，对孕妇都有着一定影响，虽然在表面情况下看对人体危害不大，但实际在辐射射线的照射下，对体内的新生儿存在一定的风险，长时间受到辐射的干扰，体内新生儿会存在先天性畸形的症状，例如小头症以及无脑儿等。
病毒感染因素：
病毒感染在孕妇怀孕前三个月的时间尤为重要，肚中的婴儿还在发育期，所有的器官都没有完全建立病毒的干扰会直接导致肚中的婴儿各种病毒源的侵略，会让婴儿的先天性畸形发育比较高。 孕妇自带的基础疾病：
孕妇在怀孕前都要按照国家规定对于自身的健康程度做体检，为了防止先天性畸形的生育率偏高，孕前的体检全部都是由国家买单，避免更多拥有一些糖尿病或者是其他基础病的孕妇在生育时引起新生儿先天畸形。
缺氧因素：
孕妇在怀孕时肚中的婴儿发育要及时关注，定期到医院做体检，婴儿在缺氧后轻则导致先天畸形，重则导致胎死症状，为安全着想，孕妇都要在规定时间内到医院做妊娠早期反应以及超声波检查。
饮酒和化学物质因素：
在怀孕期间，孕妇饮酒和进食大量的化学物质也会引起先天畸形的最主要原因，酒精的刺激和化学物质的刺激都会导致新生婴儿体内脑细胞以及骨骼发育不完全。