性激素在促进骨骼的生长，同时又促进骨垢的闭合，因此性早熟会使孩子提前终止长个，导致最终身高会低于同龄伙伴。少部分的性早熟可能是因为颅内的肿瘤压迫引起的，会出现恶心、呕吐等临床表现，有时还影响患儿视力，如果得不到及时的治疗，甚至会危及生命。

性早熟的孩子可能因为外形与同龄孩子不同，及早来的月经、阴毛出现或遗精等现象容易出现自卑感或者焦虑不安的情绪，严重的心理负担可能导致学习注意力不集中，害怕与同学相处。同时性早熟患者的心理发育与身体发育的不同步，发生早恋，早孕，早婚的风险大大的增加。